Ci sono diverse soluzioni. Dipende però dallo script, in particolare da come cambia il testo:
Una soluzione banale, se la parte "<em>1</em>" rimane invariata, sarebbe di riscriverla con il nuovo testo.
(poi dipende: se hai molte righe in questo modo, e la lunghezza della stringa invariata rimane uguale, allora puoi ricavarla contando gli ultimi caratteri e inserirli alla fine della stringa).
Un'altra soluzione, se il testo da modificare è conosciuto a priori, puoi provare recuperando l'intero testo. Poi con la
.replace() lo sostituisci e lo riassegni.
Un'altra soluzione forse più "generica", sarebbe di inserire un nuovo contenitore (tipo <span>) contenente soltanto la parte che vuoi modificare, quindi selezionare quest'ultimo con jQuery.
Ciao!