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[madn3ss]

Secondo le vostre esperienze è meglio attivare il pilota automatico o impostare manualmente i banner?

Poi seconda domanda. Quando vado in formato banner compaiono dei codici che dice di inserire nel sito. Quand'è che questi codici devono essere inseriti?

[karl94]

È sempre consigliabile cominciare con l'attivare il pilota automatico, come hai già fatto. Se usi il pilota automatico non è necessario inserire manualmente i codici.
Al più potresti aggiungere mediante il widget apposito un banner AlterVista with Google AdSense 300×600 nella barra laterale in modo che venga visualizzato circa a metà articolo.