Rallentamenti Database frequenti e problemi di accesso

Salve, mi accade spesso durante la giornata di notare dei rallentamenti nel mio database e problemi di accesso anche da PhpMyAdmin.
Per circa 20 min consecutivi il mio sito (che usa il DB) diventa inaccessibile, ho potuto notare eccessivi rallentamenti e problemi di accesso in alcune fasce serali e ogni giorno dalle 12.40 circa fino alle 13 passate.
Controllo ogni volta se ci sono lavori schedulati sul mio server che è il 16 ma non trovo riscontri.
Dispongo di query illimitate e molto spazio Web quindi non penso che sia legato a problemi di questo tipo.
Suppongo che l'eccessiva lentezza sia dovuta al traffico sul server attuale o azioni pianificate di gestione del DB, nelle ore mattutine (circa alle 7) infatti noto velocità molto elevate e le pagine si aprono istantaneamente.
C'è qualche modo per risolvere questo problema? (cambi server o altro)

Vi ringrazio per la risposta.

La macchina in questione è stata oggetto nella nottata di alcuni importanti aggiornamenti software, ci si sta ancora lavorando sebbene non ci siano annunci in merito in quanto non si prevedevano interruzioni di servizio significative, ma al più i disguidi segnalati.

Il problema dovrebbe risolversi comunque entro la nottata.