Cancellazione pagine durante caricamento ftp

Oggi durante l'aggiornamento del sito mi è capitato di imbattermi in un evento al quanto strano, in pratica dopo aver aggiornato la pagina, l'ho ricaricata sul server, ma per magia era tutto bianco, ed infatti controllando il sorgente non c'era neanche una riga di codice, per rimediare ho dovuto caricare la pagina 3 volte per avere un upload corretto. Questa cosa è avvenuta su un paio di pagine ora funzionanti.

Premetto che ho aggiornato altri siti esterni ad Altervista e non ho avuto problemi, da cosa può dipendere?