Z-index persistente

Si è verificata un'anomalia rilevata tanto nella navigazione del sito web che nella gestioe diretta dei file, da qui, dal pannello riservato all'utenza. Se si volesse controllare, il file che dà problemi è in themes/advanced, main.css, recisamente entro la definizione del tag div.output. Ho attuato una modifica impostando il z-index del suddetto tag a -100. Così però si sono verificate dei problemi di navigazione, per cui ho rimosso quella linea di codice, nel div.output. Il problema è che persiste nonostante tutto. Se si va a visualizzare, stesso nel pannello di gestione file da sito Altervista, compare ancora il z-index, mentre se apro lo stesso file, sempre con Altervista, z-index non c'è. Ho provato a rimuovere il file su server e copiare il file modificato nella medesima cartella, ma niente, non cambia.
Quale potrebbe essere il problema?