Aggiornamento Drupal nella cartella sbagliata

Salve a tutti, vi chiedo aiuto per risolvere un problema sorto dopo un aggiornamento.

Premetto che inizialmente il sito si trovava nella cartella FOIWebSite e ora è situato in WebSite (stessa cosa per il forum prima FOIForum ora Forum).

Ieri effettuo l'aggiornamento di Drupal ma tutti i file dell'aggiornamento vengono installati nella cartella FOIWebSite perciò il mio sito non è stato aggiornato.

Ora:
a. come faccio a installare eventuali aggiornamenti nella cartella WebSite e non in FOIWebSite?
b. come faccio ad aggiornare il sito, visto che sul Pannello di controllo di Altervista non c'è più questa opzione? Devo aspettare il prossimo aggiornamento Drupal?

Grazie dell'attenzione

Marco